Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Gli3Q61602 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Gli3Q61602 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Gli3Q61602 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Gli3Q61602 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Gli3Q61602 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Gli3Q61602 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Gli3Q61602 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Gli3Q61602 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Gli3Q61602 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Gli3Q61602 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Gli3Q61602 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Gli3Q61602 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Gli3Q61602 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Gli3Q61602 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Gli3Q61602 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Gli3Q61602 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Gli3Q61602 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Gli3Q61602 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Gli3Q61602 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Gli3Q61602 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Gli3Q61602 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Gli3Q61602 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Gli3Q61602 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Gli3Q61602 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Gli3Q61602 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Gli3Q61602 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Gli3Q61602 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Gli3Q61602 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Gli3Q61602 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Gli3Q61602 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Gli3Q61602 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Gli3Q61602 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Gli3Q61602 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Gli3Q61602 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Gli3Q61602 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Gli3Q61602 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Gli3Q61602 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Gli3Q61602 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Gli3Q61602 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Gli3Q61602 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Gli3Q61602 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Gli3Q61602 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Gli3Q61602 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Gli3Q61602 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Gli3Q61602 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Gli3Q61602 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Gli3Q61602 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Gli3Q61602 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Gli3Q61602 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Gli3Q61602 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Gli3Q61602 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Gli3Q61602 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Gli3Q61602 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Gli3Q61602 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Gli3Q61602 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Gli3Q61602 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Gli3Q61602 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Gli3Q61602 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Gli3Q61602 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Gli3Q61602 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Gli3Q61602 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Gli3Q61602 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Gli3Q61602 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Gli3Q61602 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Gli3Q61602 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Gli3Q61602 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Gli3Q61602 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Gli3Q61602 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Gli3Q61602 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Gli3Q61602 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Gli3Q61602 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Gli3Q61602 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Gli3Q61602 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Gli3Q61602 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Gli3Q61602 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Gli3Q61602 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Gli3Q61602 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Gli3Q61602 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Gli3Q61602 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Gli3Q61602 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Gli3Q61602 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Gli3Q61602 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Gli3Q61602 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Gli3Q61602 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Gli3Q61602 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Gli3Q61602 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Gli3Q61602 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
Gli3Q61602 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Gli3Q61602 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Gli3Q61602 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Gli3Q61602 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Gli3Q61602 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Gli3Q61602 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Gli3Q61602 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Gli3Q61602 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Gli3Q61602 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Gli3Q61602 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Gli3Q61602 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Gli3Q61602 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms