Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ift88Q61371 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ift88Q61371 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ift88Q61371 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ift88Q61371 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ift88Q61371 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ift88Q61371 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ift88Q61371 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ift88Q61371 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ift88Q61371 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ift88Q61371 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ift88Q61371 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ift88Q61371 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ift88Q61371 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ift88Q61371 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ift88Q61371 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ift88Q61371 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift88Q61371 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift88Q61371 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift88Q61371 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift88Q61371 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift88Q61371 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ift88Q61371 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ift88Q61371 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ift88Q61371 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ift88Q61371 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ift88Q61371 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ift88Q61371 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ift88Q61371 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ift88Q61371 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ift88Q61371 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ift88Q61371 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ift88Q61371 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ift88Q61371 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ift88Q61371 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ift88Q61371 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ift88Q61371 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ift88Q61371 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ift88Q61371 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ift88Q61371 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ift88Q61371 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ift88Q61371 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ift88Q61371 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ift88Q61371 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ift88Q61371 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ift88Q61371 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ift88Q61371 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ift88Q61371 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ift88Q61371 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ift88Q61371 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ift88Q61371 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ift88Q61371 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ift88Q61371 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ift88Q61371 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ift88Q61371 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ift88Q61371 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ift88Q61371 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ift88Q61371 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ift88Q61371 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ift88Q61371 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ift88Q61371 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ift88Q61371 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ift88Q61371 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ift88Q61371 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ift88Q61371 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ift88Q61371 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ift88Q61371 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ift88Q61371 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ift88Q61371 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ift88Q61371 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ift88Q61371 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ift88Q61371 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ift88Q61371 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ift88Q61371 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift88Q61371 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ift88Q61371 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms