Protein–RNA interactions for Protein: Q61312

Tfap2c, Transcription factor AP-2 gamma, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2cQ61312 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfap2cQ61312 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tfap2cQ61312 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfap2cQ61312 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfap2cQ61312 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfap2cQ61312 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfap2cQ61312 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfap2cQ61312 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfap2cQ61312 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfap2cQ61312 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfap2cQ61312 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfap2cQ61312 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfap2cQ61312 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfap2cQ61312 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfap2cQ61312 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfap2cQ61312 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tfap2cQ61312 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfap2cQ61312 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfap2cQ61312 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfap2cQ61312 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfap2cQ61312 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2cQ61312 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2cQ61312 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfap2cQ61312 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfap2cQ61312 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfap2cQ61312 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfap2cQ61312 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfap2cQ61312 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfap2cQ61312 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfap2cQ61312 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfap2cQ61312 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfap2cQ61312 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfap2cQ61312 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfap2cQ61312 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms