Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sim1Q61045 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sim1Q61045 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sim1Q61045 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sim1Q61045 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sim1Q61045 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sim1Q61045 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sim1Q61045 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sim1Q61045 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sim1Q61045 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sim1Q61045 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sim1Q61045 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sim1Q61045 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sim1Q61045 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sim1Q61045 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sim1Q61045 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sim1Q61045 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sim1Q61045 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sim1Q61045 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sim1Q61045 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sim1Q61045 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sim1Q61045 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sim1Q61045 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sim1Q61045 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sim1Q61045 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sim1Q61045 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sim1Q61045 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sim1Q61045 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sim1Q61045 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sim1Q61045 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sim1Q61045 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sim1Q61045 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sim1Q61045 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sim1Q61045 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sim1Q61045 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sim1Q61045 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sim1Q61045 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sim1Q61045 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sim1Q61045 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sim1Q61045 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sim1Q61045 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sim1Q61045 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sim1Q61045 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sim1Q61045 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sim1Q61045 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sim1Q61045 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sim1Q61045 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sim1Q61045 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sim1Q61045 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sim1Q61045 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sim1Q61045 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sim1Q61045 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sim1Q61045 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sim1Q61045 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sim1Q61045 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sim1Q61045 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sim1Q61045 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sim1Q61045 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sim1Q61045 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sim1Q61045 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sim1Q61045 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sim1Q61045 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sim1Q61045 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sim1Q61045 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sim1Q61045 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms