Protein–RNA interactions for Protein: Q61006

Musk, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 868 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MuskQ61006 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MuskQ61006 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MuskQ61006 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MuskQ61006 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MuskQ61006 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MuskQ61006 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MuskQ61006 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MuskQ61006 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MuskQ61006 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MuskQ61006 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MuskQ61006 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MuskQ61006 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MuskQ61006 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MuskQ61006 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MuskQ61006 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MuskQ61006 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MuskQ61006 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MuskQ61006 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MuskQ61006 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MuskQ61006 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MuskQ61006 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MuskQ61006 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MuskQ61006 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MuskQ61006 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MuskQ61006 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MuskQ61006 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MuskQ61006 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MuskQ61006 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MuskQ61006 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MuskQ61006 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MuskQ61006 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MuskQ61006 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MuskQ61006 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MuskQ61006 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MuskQ61006 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MuskQ61006 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MuskQ61006 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MuskQ61006 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MuskQ61006 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MuskQ61006 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MuskQ61006 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MuskQ61006 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MuskQ61006 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MuskQ61006 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MuskQ61006 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MuskQ61006 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MuskQ61006 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MuskQ61006 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MuskQ61006 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MuskQ61006 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MuskQ61006 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MuskQ61006 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MuskQ61006 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MuskQ61006 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MuskQ61006 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MuskQ61006 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MuskQ61006 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MuskQ61006 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MuskQ61006 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MuskQ61006 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MuskQ61006 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MuskQ61006 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MuskQ61006 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MuskQ61006 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MuskQ61006 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MuskQ61006 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MuskQ61006 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MuskQ61006 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MuskQ61006 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MuskQ61006 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MuskQ61006 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MuskQ61006 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MuskQ61006 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MuskQ61006 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MuskQ61006 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MuskQ61006 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MuskQ61006 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MuskQ61006 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MuskQ61006 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MuskQ61006 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MuskQ61006 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MuskQ61006 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MuskQ61006 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MuskQ61006 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MuskQ61006 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MuskQ61006 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MuskQ61006 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MuskQ61006 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MuskQ61006 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MuskQ61006 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MuskQ61006 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MuskQ61006 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MuskQ61006 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MuskQ61006 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MuskQ61006 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MuskQ61006 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MuskQ61006 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MuskQ61006 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MuskQ61006 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MuskQ61006 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms