Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klf3Q60980 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klf3Q60980 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klf3Q60980 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klf3Q60980 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf3Q60980 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf3Q60980 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf3Q60980 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf3Q60980 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klf3Q60980 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klf3Q60980 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klf3Q60980 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klf3Q60980 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klf3Q60980 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klf3Q60980 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klf3Q60980 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klf3Q60980 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klf3Q60980 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf3Q60980 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf3Q60980 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf3Q60980 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klf3Q60980 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klf3Q60980 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klf3Q60980 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klf3Q60980 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klf3Q60980 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klf3Q60980 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klf3Q60980 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klf3Q60980 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klf3Q60980 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klf3Q60980 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf3Q60980 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf3Q60980 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf3Q60980 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klf3Q60980 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klf3Q60980 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klf3Q60980 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klf3Q60980 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klf3Q60980 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klf3Q60980 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klf3Q60980 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klf3Q60980 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klf3Q60980 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klf3Q60980 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klf3Q60980 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klf3Q60980 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klf3Q60980 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klf3Q60980 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klf3Q60980 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klf3Q60980 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klf3Q60980 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klf3Q60980 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klf3Q60980 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Klf3Q60980 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klf3Q60980 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klf3Q60980 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klf3Q60980 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klf3Q60980 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klf3Q60980 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klf3Q60980 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klf3Q60980 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klf3Q60980 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klf3Q60980 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klf3Q60980 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klf3Q60980 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klf3Q60980 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Klf3Q60980 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Klf3Q60980 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klf3Q60980 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klf3Q60980 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf3Q60980 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf3Q60980 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klf3Q60980 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klf3Q60980 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klf3Q60980 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klf3Q60980 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf3Q60980 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Klf3Q60980 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms