Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
JrkQ60976 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
JrkQ60976 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
JrkQ60976 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
JrkQ60976 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
JrkQ60976 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
JrkQ60976 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
JrkQ60976 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
JrkQ60976 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
JrkQ60976 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
JrkQ60976 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
JrkQ60976 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
JrkQ60976 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
JrkQ60976 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
JrkQ60976 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
JrkQ60976 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
JrkQ60976 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
JrkQ60976 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
JrkQ60976 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
JrkQ60976 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
JrkQ60976 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
JrkQ60976 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
JrkQ60976 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
JrkQ60976 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
JrkQ60976 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
JrkQ60976 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
JrkQ60976 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
JrkQ60976 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
JrkQ60976 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
JrkQ60976 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
JrkQ60976 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
JrkQ60976 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
JrkQ60976 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
JrkQ60976 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
JrkQ60976 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
JrkQ60976 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
JrkQ60976 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
JrkQ60976 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
JrkQ60976 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
JrkQ60976 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
JrkQ60976 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
JrkQ60976 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
JrkQ60976 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
JrkQ60976 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
JrkQ60976 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
JrkQ60976 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
JrkQ60976 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
JrkQ60976 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
JrkQ60976 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
JrkQ60976 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
JrkQ60976 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
JrkQ60976 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
JrkQ60976 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
JrkQ60976 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
JrkQ60976 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
JrkQ60976 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
JrkQ60976 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
JrkQ60976 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
JrkQ60976 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
JrkQ60976 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
JrkQ60976 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
JrkQ60976 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
JrkQ60976 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
JrkQ60976 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
JrkQ60976 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
JrkQ60976 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
JrkQ60976 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
JrkQ60976 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
JrkQ60976 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
JrkQ60976 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
JrkQ60976 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
JrkQ60976 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
JrkQ60976 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
JrkQ60976 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
JrkQ60976 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
JrkQ60976 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms