Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppp1r1bQ60829 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppp1r1bQ60829 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppp1r1bQ60829 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppp1r1bQ60829 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppp1r1bQ60829 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppp1r1bQ60829 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppp1r1bQ60829 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ppp1r1bQ60829 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppp1r1bQ60829 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppp1r1bQ60829 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppp1r1bQ60829 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppp1r1bQ60829 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppp1r1bQ60829 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppp1r1bQ60829 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppp1r1bQ60829 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppp1r1bQ60829 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppp1r1bQ60829 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppp1r1bQ60829 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppp1r1bQ60829 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppp1r1bQ60829 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppp1r1bQ60829 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppp1r1bQ60829 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppp1r1bQ60829 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppp1r1bQ60829 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppp1r1bQ60829 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppp1r1bQ60829 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppp1r1bQ60829 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppp1r1bQ60829 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppp1r1bQ60829 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppp1r1bQ60829 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppp1r1bQ60829 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppp1r1bQ60829 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppp1r1bQ60829 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppp1r1bQ60829 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp1r1bQ60829 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp1r1bQ60829 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp1r1bQ60829 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp1r1bQ60829 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp1r1bQ60829 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp1r1bQ60829 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp1r1bQ60829 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp1r1bQ60829 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp1r1bQ60829 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp1r1bQ60829 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp1r1bQ60829 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp1r1bQ60829 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp1r1bQ60829 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppp1r1bQ60829 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppp1r1bQ60829 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppp1r1bQ60829 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppp1r1bQ60829 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppp1r1bQ60829 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppp1r1bQ60829 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppp1r1bQ60829 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp1r1bQ60829 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp1r1bQ60829 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp1r1bQ60829 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp1r1bQ60829 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp1r1bQ60829 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppp1r1bQ60829 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppp1r1bQ60829 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp1r1bQ60829 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp1r1bQ60829 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp1r1bQ60829 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp1r1bQ60829 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp1r1bQ60829 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp1r1bQ60829 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp1r1bQ60829 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp1r1bQ60829 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp1r1bQ60829 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp1r1bQ60829 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppp1r1bQ60829 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppp1r1bQ60829 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppp1r1bQ60829 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppp1r1bQ60829 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp1r1bQ60829 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp1r1bQ60829 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp1r1bQ60829 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppp1r1bQ60829 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppp1r1bQ60829 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppp1r1bQ60829 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppp1r1bQ60829 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppp1r1bQ60829 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppp1r1bQ60829 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppp1r1bQ60829 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppp1r1bQ60829 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppp1r1bQ60829 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppp1r1bQ60829 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppp1r1bQ60829 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppp1r1bQ60829 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppp1r1bQ60829 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppp1r1bQ60829 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppp1r1bQ60829 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ppp1r1bQ60829 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ppp1r1bQ60829 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppp1r1bQ60829 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppp1r1bQ60829 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppp1r1bQ60829 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppp1r1bQ60829 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms