Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ItgaeQ60677 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ItgaeQ60677 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ItgaeQ60677 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ItgaeQ60677 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ItgaeQ60677 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ItgaeQ60677 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ItgaeQ60677 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ItgaeQ60677 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ItgaeQ60677 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ItgaeQ60677 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ItgaeQ60677 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ItgaeQ60677 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ItgaeQ60677 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ItgaeQ60677 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ItgaeQ60677 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ItgaeQ60677 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ItgaeQ60677 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ItgaeQ60677 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ItgaeQ60677 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ItgaeQ60677 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ItgaeQ60677 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ItgaeQ60677 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ItgaeQ60677 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ItgaeQ60677 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ItgaeQ60677 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ItgaeQ60677 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ItgaeQ60677 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ItgaeQ60677 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ItgaeQ60677 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ItgaeQ60677 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ItgaeQ60677 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ItgaeQ60677 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ItgaeQ60677 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ItgaeQ60677 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ItgaeQ60677 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ItgaeQ60677 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ItgaeQ60677 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ItgaeQ60677 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ItgaeQ60677 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ItgaeQ60677 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ItgaeQ60677 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ItgaeQ60677 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ItgaeQ60677 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ItgaeQ60677 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ItgaeQ60677 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ItgaeQ60677 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ItgaeQ60677 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ItgaeQ60677 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ItgaeQ60677 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ItgaeQ60677 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ItgaeQ60677 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ItgaeQ60677 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms