Protein–RNA interactions for Protein: Q60676

Ppp5c, Serine/threonine-protein phosphatase 5, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp5cQ60676 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppp5cQ60676 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppp5cQ60676 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppp5cQ60676 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppp5cQ60676 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppp5cQ60676 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppp5cQ60676 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppp5cQ60676 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppp5cQ60676 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppp5cQ60676 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppp5cQ60676 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppp5cQ60676 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppp5cQ60676 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppp5cQ60676 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppp5cQ60676 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppp5cQ60676 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppp5cQ60676 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp5cQ60676 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp5cQ60676 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp5cQ60676 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp5cQ60676 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppp5cQ60676 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppp5cQ60676 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppp5cQ60676 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppp5cQ60676 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppp5cQ60676 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppp5cQ60676 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppp5cQ60676 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppp5cQ60676 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppp5cQ60676 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppp5cQ60676 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppp5cQ60676 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppp5cQ60676 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppp5cQ60676 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppp5cQ60676 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppp5cQ60676 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppp5cQ60676 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppp5cQ60676 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppp5cQ60676 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppp5cQ60676 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppp5cQ60676 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppp5cQ60676 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ppp5cQ60676 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ppp5cQ60676 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppp5cQ60676 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppp5cQ60676 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms