Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2f1Q60632 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2f1Q60632 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2f1Q60632 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2f1Q60632 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2f1Q60632 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2f1Q60632 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2f1Q60632 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2f1Q60632 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2f1Q60632 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2f1Q60632 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr2f1Q60632 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr2f1Q60632 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr2f1Q60632 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr2f1Q60632 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr2f1Q60632 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2f1Q60632 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2f1Q60632 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2f1Q60632 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2f1Q60632 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2f1Q60632 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2f1Q60632 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nr2f1Q60632 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2f1Q60632 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2f1Q60632 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2f1Q60632 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2f1Q60632 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2f1Q60632 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2f1Q60632 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2f1Q60632 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2f1Q60632 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2f1Q60632 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr2f1Q60632 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr2f1Q60632 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr2f1Q60632 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr2f1Q60632 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr2f1Q60632 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nr2f1Q60632 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nr2f1Q60632 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nr2f1Q60632 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nr2f1Q60632 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nr2f1Q60632 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nr2f1Q60632 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nr2f1Q60632 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nr2f1Q60632 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nr2f1Q60632 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nr2f1Q60632 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nr2f1Q60632 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nr2f1Q60632 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nr2f1Q60632 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nr2f1Q60632 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nr2f1Q60632 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nr2f1Q60632 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nr2f1Q60632 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nr2f1Q60632 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nr2f1Q60632 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nr2f1Q60632 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nr2f1Q60632 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms