Protein–RNA interactions for Protein: Q60604

Scin, Adseverin, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScinQ60604 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ScinQ60604 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ScinQ60604 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ScinQ60604 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ScinQ60604 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ScinQ60604 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ScinQ60604 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ScinQ60604 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ScinQ60604 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ScinQ60604 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ScinQ60604 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ScinQ60604 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ScinQ60604 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ScinQ60604 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ScinQ60604 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ScinQ60604 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ScinQ60604 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ScinQ60604 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ScinQ60604 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ScinQ60604 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ScinQ60604 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScinQ60604 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ScinQ60604 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ScinQ60604 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ScinQ60604 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ScinQ60604 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ScinQ60604 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ScinQ60604 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ScinQ60604 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ScinQ60604 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ScinQ60604 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ScinQ60604 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScinQ60604 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScinQ60604 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScinQ60604 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScinQ60604 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ScinQ60604 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ScinQ60604 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ScinQ60604 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ScinQ60604 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ScinQ60604 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ScinQ60604 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ScinQ60604 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ScinQ60604 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ScinQ60604 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ScinQ60604 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ScinQ60604 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ScinQ60604 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ScinQ60604 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScinQ60604 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScinQ60604 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScinQ60604 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScinQ60604 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScinQ60604 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScinQ60604 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ScinQ60604 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ScinQ60604 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ScinQ60604 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ScinQ60604 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ScinQ60604 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ScinQ60604 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ScinQ60604 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ScinQ60604 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ScinQ60604 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ScinQ60604 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScinQ60604 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScinQ60604 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ScinQ60604 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ScinQ60604 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ScinQ60604 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ScinQ60604 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ScinQ60604 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ScinQ60604 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ScinQ60604 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ScinQ60604 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ScinQ60604 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ScinQ60604 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ScinQ60604 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ScinQ60604 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ScinQ60604 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ScinQ60604 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ScinQ60604 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ScinQ60604 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ScinQ60604 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ScinQ60604 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ScinQ60604 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ScinQ60604 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ScinQ60604 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ScinQ60604 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ScinQ60604 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ScinQ60604 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ScinQ60604 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ScinQ60604 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ScinQ60604 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ScinQ60604 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ScinQ60604 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ScinQ60604 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ScinQ60604 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ScinQ60604 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ScinQ60604 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms