Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CttnQ60598 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CttnQ60598 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CttnQ60598 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CttnQ60598 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CttnQ60598 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CttnQ60598 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CttnQ60598 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CttnQ60598 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CttnQ60598 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CttnQ60598 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CttnQ60598 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CttnQ60598 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CttnQ60598 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CttnQ60598 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CttnQ60598 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CttnQ60598 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CttnQ60598 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CttnQ60598 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CttnQ60598 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CttnQ60598 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CttnQ60598 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CttnQ60598 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CttnQ60598 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CttnQ60598 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CttnQ60598 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CttnQ60598 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CttnQ60598 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CttnQ60598 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CttnQ60598 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CttnQ60598 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CttnQ60598 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CttnQ60598 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CttnQ60598 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CttnQ60598 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CttnQ60598 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CttnQ60598 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CttnQ60598 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CttnQ60598 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CttnQ60598 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CttnQ60598 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CttnQ60598 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CttnQ60598 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CttnQ60598 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CttnQ60598 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CttnQ60598 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CttnQ60598 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CttnQ60598 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CttnQ60598 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CttnQ60598 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CttnQ60598 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CttnQ60598 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CttnQ60598 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CttnQ60598 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CttnQ60598 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CttnQ60598 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CttnQ60598 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CttnQ60598 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CttnQ60598 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CttnQ60598 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CttnQ60598 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CttnQ60598 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CttnQ60598 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CttnQ60598 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CttnQ60598 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CttnQ60598 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CttnQ60598 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CttnQ60598 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CttnQ60598 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CttnQ60598 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CttnQ60598 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CttnQ60598 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CttnQ60598 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CttnQ60598 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CttnQ60598 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CttnQ60598 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CttnQ60598 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CttnQ60598 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CttnQ60598 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CttnQ60598 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CttnQ60598 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CttnQ60598 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CttnQ60598 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CttnQ60598 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CttnQ60598 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CttnQ60598 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CttnQ60598 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CttnQ60598 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CttnQ60598 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CttnQ60598 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CttnQ60598 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CttnQ60598 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CttnQ60598 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CttnQ60598 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CttnQ60598 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CttnQ60598 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CttnQ60598 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CttnQ60598 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CttnQ60598 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CttnQ60598 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms