Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rnf123Q5XPI3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rnf123Q5XPI3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rnf123Q5XPI3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rnf123Q5XPI3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rnf123Q5XPI3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rnf123Q5XPI3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rnf123Q5XPI3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rnf123Q5XPI3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rnf123Q5XPI3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rnf123Q5XPI3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rnf123Q5XPI3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rnf123Q5XPI3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rnf123Q5XPI3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rnf123Q5XPI3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rnf123Q5XPI3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rnf123Q5XPI3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rnf123Q5XPI3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rnf123Q5XPI3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rnf123Q5XPI3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Rnf123Q5XPI3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rnf123Q5XPI3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rnf123Q5XPI3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rnf123Q5XPI3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rnf123Q5XPI3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rnf123Q5XPI3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rnf123Q5XPI3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rnf123Q5XPI3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rnf123Q5XPI3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Rnf123Q5XPI3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rnf123Q5XPI3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rnf123Q5XPI3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rnf123Q5XPI3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rnf123Q5XPI3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf123Q5XPI3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf123Q5XPI3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf123Q5XPI3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf123Q5XPI3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rnf123Q5XPI3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rnf123Q5XPI3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rnf123Q5XPI3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rnf123Q5XPI3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rnf123Q5XPI3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rnf123Q5XPI3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rnf123Q5XPI3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Rnf123Q5XPI3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rnf123Q5XPI3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnf123Q5XPI3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnf123Q5XPI3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rnf123Q5XPI3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rnf123Q5XPI3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rnf123Q5XPI3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rnf123Q5XPI3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rnf123Q5XPI3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rnf123Q5XPI3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rnf123Q5XPI3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rnf123Q5XPI3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rnf123Q5XPI3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rnf123Q5XPI3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnf123Q5XPI3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnf123Q5XPI3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnf123Q5XPI3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnf123Q5XPI3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnf123Q5XPI3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnf123Q5XPI3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnf123Q5XPI3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rnf123Q5XPI3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rnf123Q5XPI3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rnf123Q5XPI3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnf123Q5XPI3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rnf123Q5XPI3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rnf123Q5XPI3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rnf123Q5XPI3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Rnf123Q5XPI3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rnf123Q5XPI3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnf123Q5XPI3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnf123Q5XPI3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnf123Q5XPI3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnf123Q5XPI3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnf123Q5XPI3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnf123Q5XPI3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnf123Q5XPI3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rnf123Q5XPI3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rnf123Q5XPI3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rnf123Q5XPI3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rnf123Q5XPI3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnf123Q5XPI3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnf123Q5XPI3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnf123Q5XPI3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnf123Q5XPI3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf123Q5XPI3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf123Q5XPI3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnf123Q5XPI3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rnf123Q5XPI3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rnf123Q5XPI3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rnf123Q5XPI3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rnf123Q5XPI3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rnf123Q5XPI3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rnf123Q5XPI3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnf123Q5XPI3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms