Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajc11Q5U458 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajc11Q5U458 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajc11Q5U458 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajc11Q5U458 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajc11Q5U458 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnajc11Q5U458 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajc11Q5U458 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajc11Q5U458 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajc11Q5U458 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajc11Q5U458 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajc11Q5U458 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajc11Q5U458 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajc11Q5U458 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajc11Q5U458 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajc11Q5U458 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajc11Q5U458 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajc11Q5U458 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnajc11Q5U458 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnajc11Q5U458 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnajc11Q5U458 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnajc11Q5U458 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajc11Q5U458 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajc11Q5U458 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajc11Q5U458 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajc11Q5U458 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajc11Q5U458 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Dnajc11Q5U458 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajc11Q5U458 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajc11Q5U458 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajc11Q5U458 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajc11Q5U458 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnajc11Q5U458 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnajc11Q5U458 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnajc11Q5U458 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnajc11Q5U458 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajc11Q5U458 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajc11Q5U458 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajc11Q5U458 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajc11Q5U458 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajc11Q5U458 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajc11Q5U458 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajc11Q5U458 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajc11Q5U458 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dnajc11Q5U458 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dnajc11Q5U458 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dnajc11Q5U458 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajc11Q5U458 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajc11Q5U458 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajc11Q5U458 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajc11Q5U458 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajc11Q5U458 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajc11Q5U458 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajc11Q5U458 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajc11Q5U458 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajc11Q5U458 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajc11Q5U458 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajc11Q5U458 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajc11Q5U458 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajc11Q5U458 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc11Q5U458 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc11Q5U458 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc11Q5U458 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc11Q5U458 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc11Q5U458 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc11Q5U458 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc11Q5U458 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dnajc11Q5U458 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc11Q5U458 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc11Q5U458 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc11Q5U458 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc11Q5U458 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc11Q5U458 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc11Q5U458 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnajc11Q5U458 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnajc11Q5U458 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnajc11Q5U458 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms