Protein–RNA interactions for Protein: Q5U406

Zfp78, Zinc finger protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp78Q5U406 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp78Q5U406 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp78Q5U406 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp78Q5U406 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp78Q5U406 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp78Q5U406 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp78Q5U406 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp78Q5U406 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp78Q5U406 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp78Q5U406 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp78Q5U406 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp78Q5U406 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp78Q5U406 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp78Q5U406 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp78Q5U406 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp78Q5U406 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp78Q5U406 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp78Q5U406 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp78Q5U406 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp78Q5U406 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp78Q5U406 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp78Q5U406 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp78Q5U406 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp78Q5U406 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp78Q5U406 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp78Q5U406 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp78Q5U406 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp78Q5U406 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp78Q5U406 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp78Q5U406 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp78Q5U406 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp78Q5U406 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp78Q5U406 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp78Q5U406 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp78Q5U406 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp78Q5U406 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp78Q5U406 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp78Q5U406 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp78Q5U406 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp78Q5U406 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp78Q5U406 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp78Q5U406 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp78Q5U406 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp78Q5U406 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp78Q5U406 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp78Q5U406 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp78Q5U406 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp78Q5U406 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp78Q5U406 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp78Q5U406 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp78Q5U406 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms