Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r195Q5SVD6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r195Q5SVD6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r195Q5SVD6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r195Q5SVD6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r195Q5SVD6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms