Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc85aQ5SP85 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc85aQ5SP85 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc85aQ5SP85 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc85aQ5SP85 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc85aQ5SP85 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc85aQ5SP85 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc85aQ5SP85 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc85aQ5SP85 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc85aQ5SP85 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc85aQ5SP85 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc85aQ5SP85 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc85aQ5SP85 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc85aQ5SP85 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc85aQ5SP85 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc85aQ5SP85 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc85aQ5SP85 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc85aQ5SP85 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc85aQ5SP85 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc85aQ5SP85 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc85aQ5SP85 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc85aQ5SP85 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc85aQ5SP85 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc85aQ5SP85 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc85aQ5SP85 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc85aQ5SP85 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc85aQ5SP85 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc85aQ5SP85 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc85aQ5SP85 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc85aQ5SP85 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc85aQ5SP85 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc85aQ5SP85 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc85aQ5SP85 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc85aQ5SP85 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc85aQ5SP85 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc85aQ5SP85 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc85aQ5SP85 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc85aQ5SP85 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc85aQ5SP85 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc85aQ5SP85 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc85aQ5SP85 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc85aQ5SP85 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc85aQ5SP85 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc85aQ5SP85 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc85aQ5SP85 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc85aQ5SP85 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc85aQ5SP85 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc85aQ5SP85 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc85aQ5SP85 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc85aQ5SP85 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc85aQ5SP85 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc85aQ5SP85 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc85aQ5SP85 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc85aQ5SP85 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc85aQ5SP85 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc85aQ5SP85 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc85aQ5SP85 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc85aQ5SP85 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc85aQ5SP85 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc85aQ5SP85 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc85aQ5SP85 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc85aQ5SP85 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc85aQ5SP85 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc85aQ5SP85 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc85aQ5SP85 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc85aQ5SP85 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc85aQ5SP85 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc85aQ5SP85 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc85aQ5SP85 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc85aQ5SP85 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc85aQ5SP85 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc85aQ5SP85 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc85aQ5SP85 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc85aQ5SP85 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc85aQ5SP85 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc85aQ5SP85 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc85aQ5SP85 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc85aQ5SP85 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc85aQ5SP85 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc85aQ5SP85 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc85aQ5SP85 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc85aQ5SP85 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc85aQ5SP85 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc85aQ5SP85 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc85aQ5SP85 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc85aQ5SP85 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc85aQ5SP85 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc85aQ5SP85 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc85aQ5SP85 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms