Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5431Q5NCB3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5431Q5NCB3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5431Q5NCB3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5431Q5NCB3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5431Q5NCB3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5431Q5NCB3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5431Q5NCB3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5431Q5NCB3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5431Q5NCB3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5431Q5NCB3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5431Q5NCB3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5431Q5NCB3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5431Q5NCB3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5431Q5NCB3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5431Q5NCB3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5431Q5NCB3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5431Q5NCB3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5431Q5NCB3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5431Q5NCB3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm5431Q5NCB3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm5431Q5NCB3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm5431Q5NCB3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5431Q5NCB3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5431Q5NCB3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5431Q5NCB3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5431Q5NCB3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5431Q5NCB3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5431Q5NCB3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5431Q5NCB3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5431Q5NCB3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5431Q5NCB3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5431Q5NCB3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5431Q5NCB3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5431Q5NCB3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5431Q5NCB3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5431Q5NCB3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm5431Q5NCB3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5431Q5NCB3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5431Q5NCB3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5431Q5NCB3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms