Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN45

UPF0691 protein C9orf116 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5BN45 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q5BN45 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q5BN45 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Q5BN45 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q5BN45 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q5BN45 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q5BN45 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q5BN45 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q5BN45 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q5BN45 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q5BN45 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q5BN45 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q5BN45 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q5BN45 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q5BN45 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q5BN45 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q5BN45 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q5BN45 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q5BN45 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q5BN45 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q5BN45 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q5BN45 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q5BN45 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q5BN45 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q5BN45 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q5BN45 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q5BN45 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q5BN45 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q5BN45 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q5BN45 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q5BN45 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q5BN45 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q5BN45 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q5BN45 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q5BN45 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q5BN45 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5BN45 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5BN45 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5BN45 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5BN45 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5BN45 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5BN45 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5BN45 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5BN45 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5BN45 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5BN45 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5BN45 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5BN45 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5BN45 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5BN45 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q5BN45 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q5BN45 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q5BN45 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q5BN45 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q5BN45 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q5BN45 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q5BN45 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q5BN45 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q5BN45 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q5BN45 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q5BN45 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q5BN45 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q5BN45 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q5BN45 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q5BN45 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q5BN45 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q5BN45 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q5BN45 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q5BN45 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q5BN45 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q5BN45 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q5BN45 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q5BN45 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q5BN45 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q5BN45 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q5BN45 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q5BN45 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q5BN45 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q5BN45 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q5BN45 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q5BN45 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q5BN45 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q5BN45 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q5BN45 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q5BN45 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q5BN45 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q5BN45 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q5BN45 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q5BN45 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q5BN45 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q5BN45 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q5BN45 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q5BN45 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q5BN45 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q5BN45 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q5BN45 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q5BN45 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q5BN45 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q5BN45 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q5BN45 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms