Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10488Q4KL05 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10488Q4KL05 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10488Q4KL05 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10488Q4KL05 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10488Q4KL05 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10488Q4KL05 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10488Q4KL05 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10488Q4KL05 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10488Q4KL05 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10488Q4KL05 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm10488Q4KL05 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10488Q4KL05 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10488Q4KL05 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10488Q4KL05 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10488Q4KL05 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10488Q4KL05 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10488Q4KL05 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm10488Q4KL05 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm10488Q4KL05 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm10488Q4KL05 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm10488Q4KL05 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10488Q4KL05 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10488Q4KL05 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10488Q4KL05 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10488Q4KL05 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10488Q4KL05 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10488Q4KL05 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10488Q4KL05 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10488Q4KL05 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10488Q4KL05 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10488Q4KL05 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10488Q4KL05 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10488Q4KL05 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm10488Q4KL05 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm10488Q4KL05 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm10488Q4KL05 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm10488Q4KL05 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm10488Q4KL05 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm10488Q4KL05 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm10488Q4KL05 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm10488Q4KL05 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm10488Q4KL05 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm10488Q4KL05 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm10488Q4KL05 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm10488Q4KL05 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm10488Q4KL05 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm10488Q4KL05 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm10488Q4KL05 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms