Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G4

BC030870, cDNA sequence BC030870, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030870Q3V2G4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC030870Q3V2G4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC030870Q3V2G4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC030870Q3V2G4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC030870Q3V2G4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC030870Q3V2G4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC030870Q3V2G4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC030870Q3V2G4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC030870Q3V2G4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC030870Q3V2G4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC030870Q3V2G4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC030870Q3V2G4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BC030870Q3V2G4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC030870Q3V2G4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC030870Q3V2G4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC030870Q3V2G4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC030870Q3V2G4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC030870Q3V2G4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC030870Q3V2G4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC030870Q3V2G4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC030870Q3V2G4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC030870Q3V2G4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC030870Q3V2G4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC030870Q3V2G4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC030870Q3V2G4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC030870Q3V2G4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC030870Q3V2G4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC030870Q3V2G4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC030870Q3V2G4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC030870Q3V2G4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC030870Q3V2G4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC030870Q3V2G4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC030870Q3V2G4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC030870Q3V2G4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC030870Q3V2G4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BC030870Q3V2G4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BC030870Q3V2G4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BC030870Q3V2G4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC030870Q3V2G4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC030870Q3V2G4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC030870Q3V2G4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC030870Q3V2G4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC030870Q3V2G4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC030870Q3V2G4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms