Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc110Q3V125 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc110Q3V125 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc110Q3V125 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc110Q3V125 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc110Q3V125 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc110Q3V125 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc110Q3V125 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc110Q3V125 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc110Q3V125 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc110Q3V125 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc110Q3V125 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc110Q3V125 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc110Q3V125 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc110Q3V125 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc110Q3V125 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc110Q3V125 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc110Q3V125 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc110Q3V125 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc110Q3V125 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc110Q3V125 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc110Q3V125 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc110Q3V125 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc110Q3V125 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc110Q3V125 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc110Q3V125 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc110Q3V125 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc110Q3V125 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc110Q3V125 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc110Q3V125 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc110Q3V125 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc110Q3V125 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc110Q3V125 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc110Q3V125 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc110Q3V125 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc110Q3V125 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc110Q3V125 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc110Q3V125 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc110Q3V125 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc110Q3V125 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc110Q3V125 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc110Q3V125 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc110Q3V125 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc110Q3V125 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc110Q3V125 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc110Q3V125 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc110Q3V125 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc110Q3V125 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc110Q3V125 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc110Q3V125 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc110Q3V125 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc110Q3V125 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc110Q3V125 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc110Q3V125 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc110Q3V125 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc110Q3V125 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc110Q3V125 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc110Q3V125 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc110Q3V125 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc110Q3V125 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc110Q3V125 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc110Q3V125 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc110Q3V125 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc110Q3V125 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc110Q3V125 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc110Q3V125 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc110Q3V125 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc110Q3V125 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc110Q3V125 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc110Q3V125 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc110Q3V125 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc110Q3V125 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc110Q3V125 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc110Q3V125 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc110Q3V125 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms