Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc185Q3V118 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc185Q3V118 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc185Q3V118 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc185Q3V118 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc185Q3V118 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc185Q3V118 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc185Q3V118 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc185Q3V118 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc185Q3V118 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc185Q3V118 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc185Q3V118 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc185Q3V118 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc185Q3V118 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc185Q3V118 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc185Q3V118 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc185Q3V118 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc185Q3V118 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc185Q3V118 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc185Q3V118 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc185Q3V118 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc185Q3V118 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc185Q3V118 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc185Q3V118 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc185Q3V118 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc185Q3V118 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc185Q3V118 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc185Q3V118 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc185Q3V118 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc185Q3V118 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc185Q3V118 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc185Q3V118 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc185Q3V118 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc185Q3V118 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc185Q3V118 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc185Q3V118 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc185Q3V118 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc185Q3V118 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc185Q3V118 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms