Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn34b4Q3V0X2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn34b4Q3V0X2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn34b4Q3V0X2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn34b4Q3V0X2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn34b4Q3V0X2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn34b4Q3V0X2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn34b4Q3V0X2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn34b4Q3V0X2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn34b4Q3V0X2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn34b4Q3V0X2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn34b4Q3V0X2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn34b4Q3V0X2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn34b4Q3V0X2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn34b4Q3V0X2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn34b4Q3V0X2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn34b4Q3V0X2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn34b4Q3V0X2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn34b4Q3V0X2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn34b4Q3V0X2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn34b4Q3V0X2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn34b4Q3V0X2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn34b4Q3V0X2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn34b4Q3V0X2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn34b4Q3V0X2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn34b4Q3V0X2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn34b4Q3V0X2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn34b4Q3V0X2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn34b4Q3V0X2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn34b4Q3V0X2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn34b4Q3V0X2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn34b4Q3V0X2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn34b4Q3V0X2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn34b4Q3V0X2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn34b4Q3V0X2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn34b4Q3V0X2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn34b4Q3V0X2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn34b4Q3V0X2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn34b4Q3V0X2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn34b4Q3V0X2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn34b4Q3V0X2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn34b4Q3V0X2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn34b4Q3V0X2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn34b4Q3V0X2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn34b4Q3V0X2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn34b4Q3V0X2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn34b4Q3V0X2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn34b4Q3V0X2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn34b4Q3V0X2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn34b4Q3V0X2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn34b4Q3V0X2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn34b4Q3V0X2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn34b4Q3V0X2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn34b4Q3V0X2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn34b4Q3V0X2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn34b4Q3V0X2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn34b4Q3V0X2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn34b4Q3V0X2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn34b4Q3V0X2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn34b4Q3V0X2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn34b4Q3V0X2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn34b4Q3V0X2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn34b4Q3V0X2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn34b4Q3V0X2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn34b4Q3V0X2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn34b4Q3V0X2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms