Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0W9

4930432M17Rik, RIKEN cDNA 4930432M17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930432M17RikQ3V0W9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930432M17RikQ3V0W9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930432M17RikQ3V0W9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms