Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ankrd53Q3V0J4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ankrd53Q3V0J4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ankrd53Q3V0J4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd53Q3V0J4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd53Q3V0J4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd53Q3V0J4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd53Q3V0J4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd53Q3V0J4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd53Q3V0J4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd53Q3V0J4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd53Q3V0J4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd53Q3V0J4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd53Q3V0J4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd53Q3V0J4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd53Q3V0J4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd53Q3V0J4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd53Q3V0J4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd53Q3V0J4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd53Q3V0J4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd53Q3V0J4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd53Q3V0J4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd53Q3V0J4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd53Q3V0J4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd53Q3V0J4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd53Q3V0J4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd53Q3V0J4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd53Q3V0J4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd53Q3V0J4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd53Q3V0J4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd53Q3V0J4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd53Q3V0J4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd53Q3V0J4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd53Q3V0J4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd53Q3V0J4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd53Q3V0J4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd53Q3V0J4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd53Q3V0J4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd53Q3V0J4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd53Q3V0J4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd53Q3V0J4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd53Q3V0J4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd53Q3V0J4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd53Q3V0J4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd53Q3V0J4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd53Q3V0J4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd53Q3V0J4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd53Q3V0J4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd53Q3V0J4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd53Q3V0J4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd53Q3V0J4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd53Q3V0J4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd53Q3V0J4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd53Q3V0J4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd53Q3V0J4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd53Q3V0J4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd53Q3V0J4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd53Q3V0J4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd53Q3V0J4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd53Q3V0J4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd53Q3V0J4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd53Q3V0J4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd53Q3V0J4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd53Q3V0J4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd53Q3V0J4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd53Q3V0J4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd53Q3V0J4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd53Q3V0J4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd53Q3V0J4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd53Q3V0J4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd53Q3V0J4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd53Q3V0J4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd53Q3V0J4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd53Q3V0J4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd53Q3V0J4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd53Q3V0J4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd53Q3V0J4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd53Q3V0J4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd53Q3V0J4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd53Q3V0J4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd53Q3V0J4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd53Q3V0J4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd53Q3V0J4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd53Q3V0J4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd53Q3V0J4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd53Q3V0J4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd53Q3V0J4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd53Q3V0J4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd53Q3V0J4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ankrd53Q3V0J4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd53Q3V0J4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd53Q3V0J4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd53Q3V0J4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd53Q3V0J4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd53Q3V0J4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd53Q3V0J4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd53Q3V0J4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd53Q3V0J4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd53Q3V0J4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms