Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pfdn4Q3UWL8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pfdn4Q3UWL8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pfdn4Q3UWL8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pfdn4Q3UWL8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pfdn4Q3UWL8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pfdn4Q3UWL8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pfdn4Q3UWL8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pfdn4Q3UWL8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pfdn4Q3UWL8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pfdn4Q3UWL8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pfdn4Q3UWL8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pfdn4Q3UWL8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfdn4Q3UWL8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfdn4Q3UWL8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pfdn4Q3UWL8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pfdn4Q3UWL8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pfdn4Q3UWL8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pfdn4Q3UWL8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pfdn4Q3UWL8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pfdn4Q3UWL8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pfdn4Q3UWL8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pfdn4Q3UWL8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pfdn4Q3UWL8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pfdn4Q3UWL8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pfdn4Q3UWL8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.7 ms