Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BB287469Q3UT53 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BB287469Q3UT53 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BB287469Q3UT53 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BB287469Q3UT53 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BB287469Q3UT53 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BB287469Q3UT53 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BB287469Q3UT53 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BB287469Q3UT53 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BB287469Q3UT53 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BB287469Q3UT53 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BB287469Q3UT53 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BB287469Q3UT53 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BB287469Q3UT53 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BB287469Q3UT53 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BB287469Q3UT53 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BB287469Q3UT53 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BB287469Q3UT53 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BB287469Q3UT53 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BB287469Q3UT53 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BB287469Q3UT53 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BB287469Q3UT53 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BB287469Q3UT53 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BB287469Q3UT53 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BB287469Q3UT53 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BB287469Q3UT53 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BB287469Q3UT53 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BB287469Q3UT53 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BB287469Q3UT53 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BB287469Q3UT53 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BB287469Q3UT53 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BB287469Q3UT53 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BB287469Q3UT53 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BB287469Q3UT53 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BB287469Q3UT53 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BB287469Q3UT53 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BB287469Q3UT53 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BB287469Q3UT53 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BB287469Q3UT53 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BB287469Q3UT53 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BB287469Q3UT53 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BB287469Q3UT53 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BB287469Q3UT53 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BB287469Q3UT53 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BB287469Q3UT53 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BB287469Q3UT53 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BB287469Q3UT53 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BB287469Q3UT53 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BB287469Q3UT53 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BB287469Q3UT53 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BB287469Q3UT53 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BB287469Q3UT53 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BB287469Q3UT53 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BB287469Q3UT53 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BB287469Q3UT53 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BB287469Q3UT53 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BB287469Q3UT53 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BB287469Q3UT53 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BB287469Q3UT53 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BB287469Q3UT53 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BB287469Q3UT53 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BB287469Q3UT53 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BB287469Q3UT53 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BB287469Q3UT53 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BB287469Q3UT53 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BB287469Q3UT53 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BB287469Q3UT53 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BB287469Q3UT53 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BB287469Q3UT53 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BB287469Q3UT53 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BB287469Q3UT53 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BB287469Q3UT53 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BB287469Q3UT53 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BB287469Q3UT53 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BB287469Q3UT53 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BB287469Q3UT53 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BB287469Q3UT53 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BB287469Q3UT53 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BB287469Q3UT53 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BB287469Q3UT53 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BB287469Q3UT53 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BB287469Q3UT53 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BB287469Q3UT53 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BB287469Q3UT53 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BB287469Q3UT53 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BB287469Q3UT53 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BB287469Q3UT53 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BB287469Q3UT53 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BB287469Q3UT53 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BB287469Q3UT53 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BB287469Q3UT53 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BB287469Q3UT53 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BB287469Q3UT53 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BB287469Q3UT53 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BB287469Q3UT53 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BB287469Q3UT53 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BB287469Q3UT53 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BB287469Q3UT53 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BB287469Q3UT53 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BB287469Q3UT53 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms