Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TceancQ3US16 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TceancQ3US16 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TceancQ3US16 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TceancQ3US16 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TceancQ3US16 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TceancQ3US16 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TceancQ3US16 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TceancQ3US16 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TceancQ3US16 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TceancQ3US16 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TceancQ3US16 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TceancQ3US16 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TceancQ3US16 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TceancQ3US16 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TceancQ3US16 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TceancQ3US16 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TceancQ3US16 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TceancQ3US16 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TceancQ3US16 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TceancQ3US16 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TceancQ3US16 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TceancQ3US16 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TceancQ3US16 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TceancQ3US16 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TceancQ3US16 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TceancQ3US16 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TceancQ3US16 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TceancQ3US16 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TceancQ3US16 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TceancQ3US16 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TceancQ3US16 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TceancQ3US16 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TceancQ3US16 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TceancQ3US16 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TceancQ3US16 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TceancQ3US16 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TceancQ3US16 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TceancQ3US16 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TceancQ3US16 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TceancQ3US16 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TceancQ3US16 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TceancQ3US16 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TceancQ3US16 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TceancQ3US16 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TceancQ3US16 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TceancQ3US16 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TceancQ3US16 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TceancQ3US16 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TceancQ3US16 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TceancQ3US16 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TceancQ3US16 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TceancQ3US16 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TceancQ3US16 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TceancQ3US16 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TceancQ3US16 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TceancQ3US16 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TceancQ3US16 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TceancQ3US16 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TceancQ3US16 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TceancQ3US16 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TceancQ3US16 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TceancQ3US16 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TceancQ3US16 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TceancQ3US16 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TceancQ3US16 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TceancQ3US16 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TceancQ3US16 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TceancQ3US16 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TceancQ3US16 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TceancQ3US16 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TceancQ3US16 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TceancQ3US16 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TceancQ3US16 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TceancQ3US16 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TceancQ3US16 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TceancQ3US16 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TceancQ3US16 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TceancQ3US16 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TceancQ3US16 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TceancQ3US16 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TceancQ3US16 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TceancQ3US16 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TceancQ3US16 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TceancQ3US16 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TceancQ3US16 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TceancQ3US16 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TceancQ3US16 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TceancQ3US16 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TceancQ3US16 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TceancQ3US16 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TceancQ3US16 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TceancQ3US16 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TceancQ3US16 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TceancQ3US16 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TceancQ3US16 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TceancQ3US16 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TceancQ3US16 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TceancQ3US16 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TceancQ3US16 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms