Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mindy4Q3UQI9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mindy4Q3UQI9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Mindy4Q3UQI9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mindy4Q3UQI9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mindy4Q3UQI9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Mindy4Q3UQI9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mindy4Q3UQI9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mindy4Q3UQI9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mindy4Q3UQI9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mindy4Q3UQI9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mindy4Q3UQI9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mindy4Q3UQI9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mindy4Q3UQI9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mindy4Q3UQI9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mindy4Q3UQI9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mindy4Q3UQI9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Mindy4Q3UQI9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mindy4Q3UQI9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mindy4Q3UQI9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mindy4Q3UQI9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mindy4Q3UQI9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mindy4Q3UQI9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mindy4Q3UQI9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mindy4Q3UQI9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mindy4Q3UQI9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mindy4Q3UQI9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mindy4Q3UQI9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mindy4Q3UQI9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mindy4Q3UQI9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mindy4Q3UQI9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mindy4Q3UQI9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mindy4Q3UQI9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mindy4Q3UQI9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mindy4Q3UQI9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mindy4Q3UQI9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mindy4Q3UQI9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mindy4Q3UQI9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Mindy4Q3UQI9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mindy4Q3UQI9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mindy4Q3UQI9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mindy4Q3UQI9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mindy4Q3UQI9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Mindy4Q3UQI9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mindy4Q3UQI9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mindy4Q3UQI9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Mindy4Q3UQI9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mindy4Q3UQI9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mindy4Q3UQI9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mindy4Q3UQI9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mindy4Q3UQI9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mindy4Q3UQI9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mindy4Q3UQI9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mindy4Q3UQI9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mindy4Q3UQI9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mindy4Q3UQI9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mindy4Q3UQI9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mindy4Q3UQI9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mindy4Q3UQI9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mindy4Q3UQI9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mindy4Q3UQI9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mindy4Q3UQI9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mindy4Q3UQI9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mindy4Q3UQI9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mindy4Q3UQI9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mindy4Q3UQI9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mindy4Q3UQI9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mindy4Q3UQI9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mindy4Q3UQI9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Mindy4Q3UQI9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mindy4Q3UQI9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mindy4Q3UQI9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mindy4Q3UQI9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mindy4Q3UQI9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mindy4Q3UQI9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mindy4Q3UQI9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mindy4Q3UQI9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mindy4Q3UQI9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mindy4Q3UQI9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mindy4Q3UQI9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mindy4Q3UQI9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mindy4Q3UQI9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Mindy4Q3UQI9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Mindy4Q3UQI9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mindy4Q3UQI9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mindy4Q3UQI9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mindy4Q3UQI9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mindy4Q3UQI9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mindy4Q3UQI9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mindy4Q3UQI9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mindy4Q3UQI9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mindy4Q3UQI9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mindy4Q3UQI9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mindy4Q3UQI9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mindy4Q3UQI9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mindy4Q3UQI9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mindy4Q3UQI9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mindy4Q3UQI9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mindy4Q3UQI9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mindy4Q3UQI9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms