Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc61Q3UJV1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc61Q3UJV1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc61Q3UJV1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc61Q3UJV1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc61Q3UJV1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc61Q3UJV1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc61Q3UJV1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc61Q3UJV1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc61Q3UJV1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc61Q3UJV1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc61Q3UJV1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc61Q3UJV1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc61Q3UJV1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc61Q3UJV1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc61Q3UJV1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc61Q3UJV1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc61Q3UJV1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc61Q3UJV1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc61Q3UJV1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc61Q3UJV1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc61Q3UJV1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc61Q3UJV1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc61Q3UJV1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc61Q3UJV1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc61Q3UJV1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc61Q3UJV1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc61Q3UJV1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc61Q3UJV1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc61Q3UJV1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc61Q3UJV1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc61Q3UJV1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc61Q3UJV1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc61Q3UJV1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc61Q3UJV1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc61Q3UJV1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc61Q3UJV1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc61Q3UJV1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc61Q3UJV1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc61Q3UJV1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc61Q3UJV1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc61Q3UJV1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc61Q3UJV1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc61Q3UJV1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc61Q3UJV1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc61Q3UJV1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc61Q3UJV1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc61Q3UJV1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc61Q3UJV1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc61Q3UJV1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc61Q3UJV1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc61Q3UJV1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc61Q3UJV1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc61Q3UJV1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc61Q3UJV1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc61Q3UJV1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc61Q3UJV1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc61Q3UJV1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc61Q3UJV1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc61Q3UJV1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc61Q3UJV1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc61Q3UJV1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc61Q3UJV1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc61Q3UJV1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc61Q3UJV1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc61Q3UJV1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc61Q3UJV1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc61Q3UJV1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc61Q3UJV1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc61Q3UJV1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc61Q3UJV1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc61Q3UJV1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc61Q3UJV1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc61Q3UJV1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc61Q3UJV1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc61Q3UJV1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc61Q3UJV1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc61Q3UJV1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc61Q3UJV1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc61Q3UJV1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc61Q3UJV1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc61Q3UJV1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc61Q3UJV1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc61Q3UJV1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc61Q3UJV1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc61Q3UJV1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc61Q3UJV1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc61Q3UJV1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc61Q3UJV1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc61Q3UJV1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc61Q3UJV1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc61Q3UJV1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc61Q3UJV1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc61Q3UJV1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc61Q3UJV1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc61Q3UJV1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms