Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Greb1Q3UHK3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Greb1Q3UHK3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Greb1Q3UHK3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Greb1Q3UHK3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Greb1Q3UHK3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Greb1Q3UHK3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Greb1Q3UHK3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Greb1Q3UHK3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Greb1Q3UHK3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Greb1Q3UHK3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Greb1Q3UHK3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Greb1Q3UHK3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Greb1Q3UHK3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Greb1Q3UHK3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Greb1Q3UHK3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Greb1Q3UHK3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Greb1Q3UHK3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Greb1Q3UHK3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Greb1Q3UHK3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Greb1Q3UHK3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Greb1Q3UHK3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Greb1Q3UHK3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Greb1Q3UHK3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Greb1Q3UHK3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Greb1Q3UHK3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Greb1Q3UHK3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Greb1Q3UHK3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Greb1Q3UHK3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Greb1Q3UHK3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Greb1Q3UHK3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Greb1Q3UHK3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Greb1Q3UHK3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Greb1Q3UHK3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Greb1Q3UHK3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Greb1Q3UHK3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Greb1Q3UHK3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Greb1Q3UHK3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Greb1Q3UHK3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Greb1Q3UHK3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Greb1Q3UHK3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Greb1Q3UHK3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Greb1Q3UHK3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Greb1Q3UHK3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Greb1Q3UHK3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Greb1Q3UHK3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Greb1Q3UHK3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Greb1Q3UHK3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Greb1Q3UHK3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Greb1Q3UHK3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Greb1Q3UHK3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Greb1Q3UHK3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Greb1Q3UHK3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Greb1Q3UHK3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Greb1Q3UHK3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Greb1Q3UHK3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Greb1Q3UHK3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Greb1Q3UHK3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Greb1Q3UHK3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Greb1Q3UHK3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Greb1Q3UHK3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Greb1Q3UHK3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Greb1Q3UHK3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Greb1Q3UHK3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Greb1Q3UHK3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Greb1Q3UHK3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Greb1Q3UHK3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Greb1Q3UHK3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Greb1Q3UHK3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Greb1Q3UHK3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Greb1Q3UHK3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Greb1Q3UHK3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Greb1Q3UHK3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Greb1Q3UHK3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Greb1Q3UHK3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Greb1Q3UHK3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Greb1Q3UHK3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Greb1Q3UHK3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Greb1Q3UHK3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Greb1Q3UHK3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Greb1Q3UHK3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Greb1Q3UHK3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Greb1Q3UHK3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Greb1Q3UHK3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Greb1Q3UHK3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Greb1Q3UHK3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Greb1Q3UHK3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Greb1Q3UHK3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Greb1Q3UHK3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Greb1Q3UHK3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Greb1Q3UHK3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Greb1Q3UHK3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Greb1Q3UHK3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Greb1Q3UHK3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Greb1Q3UHK3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Greb1Q3UHK3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Greb1Q3UHK3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Greb1Q3UHK3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Greb1Q3UHK3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Greb1Q3UHK3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms