Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nom1Q3UFM5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nom1Q3UFM5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nom1Q3UFM5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Nom1Q3UFM5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nom1Q3UFM5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nom1Q3UFM5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nom1Q3UFM5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nom1Q3UFM5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nom1Q3UFM5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nom1Q3UFM5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nom1Q3UFM5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nom1Q3UFM5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nom1Q3UFM5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nom1Q3UFM5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nom1Q3UFM5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nom1Q3UFM5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nom1Q3UFM5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Nom1Q3UFM5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nom1Q3UFM5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nom1Q3UFM5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nom1Q3UFM5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nom1Q3UFM5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nom1Q3UFM5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nom1Q3UFM5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nom1Q3UFM5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nom1Q3UFM5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nom1Q3UFM5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Nom1Q3UFM5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nom1Q3UFM5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nom1Q3UFM5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nom1Q3UFM5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nom1Q3UFM5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nom1Q3UFM5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nom1Q3UFM5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nom1Q3UFM5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nom1Q3UFM5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nom1Q3UFM5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nom1Q3UFM5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nom1Q3UFM5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nom1Q3UFM5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Nom1Q3UFM5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nom1Q3UFM5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Nom1Q3UFM5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nom1Q3UFM5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nom1Q3UFM5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nom1Q3UFM5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nom1Q3UFM5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nom1Q3UFM5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nom1Q3UFM5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nom1Q3UFM5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nom1Q3UFM5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nom1Q3UFM5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nom1Q3UFM5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nom1Q3UFM5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nom1Q3UFM5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nom1Q3UFM5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nom1Q3UFM5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nom1Q3UFM5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Nom1Q3UFM5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nom1Q3UFM5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nom1Q3UFM5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nom1Q3UFM5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nom1Q3UFM5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nom1Q3UFM5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nom1Q3UFM5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nom1Q3UFM5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nom1Q3UFM5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nom1Q3UFM5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nom1Q3UFM5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nom1Q3UFM5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nom1Q3UFM5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Nom1Q3UFM5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms