Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

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Length 584 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam117bQ3U3E2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam117bQ3U3E2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam117bQ3U3E2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam117bQ3U3E2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam117bQ3U3E2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam117bQ3U3E2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam117bQ3U3E2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam117bQ3U3E2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam117bQ3U3E2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam117bQ3U3E2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam117bQ3U3E2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam117bQ3U3E2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam117bQ3U3E2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam117bQ3U3E2 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam117bQ3U3E2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam117bQ3U3E2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam117bQ3U3E2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam117bQ3U3E2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam117bQ3U3E2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam117bQ3U3E2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam117bQ3U3E2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam117bQ3U3E2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam117bQ3U3E2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam117bQ3U3E2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam117bQ3U3E2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam117bQ3U3E2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam117bQ3U3E2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam117bQ3U3E2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam117bQ3U3E2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam117bQ3U3E2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam117bQ3U3E2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam117bQ3U3E2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam117bQ3U3E2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam117bQ3U3E2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam117bQ3U3E2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam117bQ3U3E2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam117bQ3U3E2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam117bQ3U3E2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam117bQ3U3E2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam117bQ3U3E2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam117bQ3U3E2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam117bQ3U3E2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam117bQ3U3E2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam117bQ3U3E2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam117bQ3U3E2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam117bQ3U3E2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam117bQ3U3E2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam117bQ3U3E2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam117bQ3U3E2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam117bQ3U3E2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam117bQ3U3E2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam117bQ3U3E2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam117bQ3U3E2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam117bQ3U3E2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam117bQ3U3E2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam117bQ3U3E2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam117bQ3U3E2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam117bQ3U3E2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam117bQ3U3E2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam117bQ3U3E2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam117bQ3U3E2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam117bQ3U3E2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam117bQ3U3E2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam117bQ3U3E2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam117bQ3U3E2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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