Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm4dQ3U2K5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm4dQ3U2K5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm4dQ3U2K5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm4dQ3U2K5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm4dQ3U2K5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm4dQ3U2K5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm4dQ3U2K5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm4dQ3U2K5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm4dQ3U2K5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm4dQ3U2K5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm4dQ3U2K5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm4dQ3U2K5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kdm4dQ3U2K5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm4dQ3U2K5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4dQ3U2K5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm4dQ3U2K5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm4dQ3U2K5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm4dQ3U2K5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm4dQ3U2K5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm4dQ3U2K5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm4dQ3U2K5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm4dQ3U2K5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm4dQ3U2K5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm4dQ3U2K5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm4dQ3U2K5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm4dQ3U2K5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kdm4dQ3U2K5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kdm4dQ3U2K5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kdm4dQ3U2K5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4dQ3U2K5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4dQ3U2K5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4dQ3U2K5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4dQ3U2K5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4dQ3U2K5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4dQ3U2K5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4dQ3U2K5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4dQ3U2K5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4dQ3U2K5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4dQ3U2K5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4dQ3U2K5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm4dQ3U2K5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm4dQ3U2K5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm4dQ3U2K5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm4dQ3U2K5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm4dQ3U2K5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Kdm4dQ3U2K5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm4dQ3U2K5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm4dQ3U2K5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm4dQ3U2K5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm4dQ3U2K5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm4dQ3U2K5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm4dQ3U2K5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4dQ3U2K5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4dQ3U2K5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4dQ3U2K5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4dQ3U2K5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4dQ3U2K5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4dQ3U2K5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm4dQ3U2K5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm4dQ3U2K5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4dQ3U2K5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4dQ3U2K5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4dQ3U2K5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4dQ3U2K5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4dQ3U2K5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4dQ3U2K5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4dQ3U2K5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4dQ3U2K5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4dQ3U2K5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4dQ3U2K5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4dQ3U2K5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4dQ3U2K5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm4dQ3U2K5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm4dQ3U2K5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm4dQ3U2K5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm4dQ3U2K5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm4dQ3U2K5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm4dQ3U2K5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm4dQ3U2K5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm4dQ3U2K5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4dQ3U2K5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4dQ3U2K5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4dQ3U2K5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4dQ3U2K5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4dQ3U2K5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4dQ3U2K5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm4dQ3U2K5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm4dQ3U2K5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms