Protein–RNA interactions for Protein: Q3U108

Arid5a, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid5aQ3U108 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arid5aQ3U108 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arid5aQ3U108 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arid5aQ3U108 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arid5aQ3U108 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arid5aQ3U108 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arid5aQ3U108 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arid5aQ3U108 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arid5aQ3U108 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arid5aQ3U108 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arid5aQ3U108 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arid5aQ3U108 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arid5aQ3U108 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arid5aQ3U108 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arid5aQ3U108 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arid5aQ3U108 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arid5aQ3U108 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arid5aQ3U108 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arid5aQ3U108 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arid5aQ3U108 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arid5aQ3U108 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid5aQ3U108 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid5aQ3U108 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid5aQ3U108 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid5aQ3U108 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arid5aQ3U108 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid5aQ3U108 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid5aQ3U108 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid5aQ3U108 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arid5aQ3U108 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid5aQ3U108 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid5aQ3U108 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid5aQ3U108 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid5aQ3U108 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arid5aQ3U108 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arid5aQ3U108 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arid5aQ3U108 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arid5aQ3U108 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arid5aQ3U108 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arid5aQ3U108 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Arid5aQ3U108 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arid5aQ3U108 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid5aQ3U108 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid5aQ3U108 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid5aQ3U108 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid5aQ3U108 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid5aQ3U108 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid5aQ3U108 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid5aQ3U108 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid5aQ3U108 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid5aQ3U108 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Arid5aQ3U108 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arid5aQ3U108 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.7 ms