Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Palb2Q3U0P1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Palb2Q3U0P1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Palb2Q3U0P1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Palb2Q3U0P1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Palb2Q3U0P1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Palb2Q3U0P1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Palb2Q3U0P1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Palb2Q3U0P1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Palb2Q3U0P1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Palb2Q3U0P1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Palb2Q3U0P1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Palb2Q3U0P1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Palb2Q3U0P1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Palb2Q3U0P1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Palb2Q3U0P1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Palb2Q3U0P1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Palb2Q3U0P1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Palb2Q3U0P1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Palb2Q3U0P1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Palb2Q3U0P1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Palb2Q3U0P1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Palb2Q3U0P1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Palb2Q3U0P1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Palb2Q3U0P1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Palb2Q3U0P1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Palb2Q3U0P1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Palb2Q3U0P1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Palb2Q3U0P1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Palb2Q3U0P1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Palb2Q3U0P1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Palb2Q3U0P1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Palb2Q3U0P1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Palb2Q3U0P1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Palb2Q3U0P1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Palb2Q3U0P1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Palb2Q3U0P1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Palb2Q3U0P1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Palb2Q3U0P1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Palb2Q3U0P1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Palb2Q3U0P1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Palb2Q3U0P1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Palb2Q3U0P1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Palb2Q3U0P1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Palb2Q3U0P1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Palb2Q3U0P1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Palb2Q3U0P1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Palb2Q3U0P1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Palb2Q3U0P1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Palb2Q3U0P1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Palb2Q3U0P1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Palb2Q3U0P1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Palb2Q3U0P1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Palb2Q3U0P1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Palb2Q3U0P1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Palb2Q3U0P1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Palb2Q3U0P1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Palb2Q3U0P1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Palb2Q3U0P1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Palb2Q3U0P1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Palb2Q3U0P1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Palb2Q3U0P1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms