Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0I6

Smim6, MCG148180, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim6Q3U0I6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim6Q3U0I6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim6Q3U0I6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim6Q3U0I6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim6Q3U0I6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim6Q3U0I6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim6Q3U0I6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim6Q3U0I6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim6Q3U0I6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim6Q3U0I6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim6Q3U0I6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim6Q3U0I6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim6Q3U0I6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim6Q3U0I6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim6Q3U0I6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim6Q3U0I6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim6Q3U0I6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim6Q3U0I6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim6Q3U0I6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim6Q3U0I6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms