Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hace1Q3U0D9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hace1Q3U0D9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hace1Q3U0D9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hace1Q3U0D9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hace1Q3U0D9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hace1Q3U0D9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Hace1Q3U0D9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hace1Q3U0D9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hace1Q3U0D9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hace1Q3U0D9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hace1Q3U0D9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hace1Q3U0D9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hace1Q3U0D9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hace1Q3U0D9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hace1Q3U0D9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hace1Q3U0D9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hace1Q3U0D9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hace1Q3U0D9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Hace1Q3U0D9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hace1Q3U0D9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hace1Q3U0D9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hace1Q3U0D9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hace1Q3U0D9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hace1Q3U0D9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hace1Q3U0D9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hace1Q3U0D9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hace1Q3U0D9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hace1Q3U0D9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hace1Q3U0D9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hace1Q3U0D9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hace1Q3U0D9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hace1Q3U0D9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hace1Q3U0D9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hace1Q3U0D9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hace1Q3U0D9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hace1Q3U0D9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hace1Q3U0D9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hace1Q3U0D9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hace1Q3U0D9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hace1Q3U0D9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hace1Q3U0D9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hace1Q3U0D9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hace1Q3U0D9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hace1Q3U0D9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hace1Q3U0D9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hace1Q3U0D9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hace1Q3U0D9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hace1Q3U0D9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hace1Q3U0D9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hace1Q3U0D9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hace1Q3U0D9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hace1Q3U0D9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hace1Q3U0D9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hace1Q3U0D9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hace1Q3U0D9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hace1Q3U0D9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hace1Q3U0D9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hace1Q3U0D9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hace1Q3U0D9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hace1Q3U0D9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hace1Q3U0D9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Hace1Q3U0D9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hace1Q3U0D9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hace1Q3U0D9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hace1Q3U0D9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hace1Q3U0D9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Hace1Q3U0D9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hace1Q3U0D9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hace1Q3U0D9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hace1Q3U0D9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hace1Q3U0D9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hace1Q3U0D9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hace1Q3U0D9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hace1Q3U0D9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hace1Q3U0D9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hace1Q3U0D9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hace1Q3U0D9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hace1Q3U0D9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hace1Q3U0D9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hace1Q3U0D9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hace1Q3U0D9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hace1Q3U0D9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hace1Q3U0D9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hace1Q3U0D9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hace1Q3U0D9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hace1Q3U0D9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hace1Q3U0D9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hace1Q3U0D9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hace1Q3U0D9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hace1Q3U0D9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hace1Q3U0D9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hace1Q3U0D9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hace1Q3U0D9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hace1Q3U0D9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hace1Q3U0D9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hace1Q3U0D9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hace1Q3U0D9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hace1Q3U0D9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hace1Q3U0D9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms