Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX3

Zfyve27, Protrudin, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfyve27Q3TXX3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfyve27Q3TXX3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfyve27Q3TXX3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfyve27Q3TXX3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfyve27Q3TXX3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfyve27Q3TXX3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfyve27Q3TXX3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfyve27Q3TXX3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfyve27Q3TXX3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfyve27Q3TXX3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfyve27Q3TXX3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfyve27Q3TXX3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfyve27Q3TXX3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfyve27Q3TXX3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfyve27Q3TXX3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfyve27Q3TXX3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfyve27Q3TXX3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfyve27Q3TXX3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfyve27Q3TXX3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfyve27Q3TXX3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfyve27Q3TXX3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfyve27Q3TXX3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfyve27Q3TXX3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfyve27Q3TXX3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfyve27Q3TXX3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfyve27Q3TXX3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfyve27Q3TXX3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfyve27Q3TXX3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfyve27Q3TXX3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfyve27Q3TXX3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfyve27Q3TXX3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfyve27Q3TXX3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfyve27Q3TXX3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfyve27Q3TXX3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfyve27Q3TXX3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfyve27Q3TXX3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfyve27Q3TXX3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfyve27Q3TXX3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfyve27Q3TXX3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfyve27Q3TXX3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfyve27Q3TXX3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfyve27Q3TXX3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfyve27Q3TXX3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfyve27Q3TXX3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Zfyve27Q3TXX3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfyve27Q3TXX3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfyve27Q3TXX3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.3 ms