Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
InipQ3TXT3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
InipQ3TXT3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
InipQ3TXT3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
InipQ3TXT3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
InipQ3TXT3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
InipQ3TXT3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
InipQ3TXT3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
InipQ3TXT3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
InipQ3TXT3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
InipQ3TXT3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
InipQ3TXT3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
InipQ3TXT3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
InipQ3TXT3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
InipQ3TXT3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
InipQ3TXT3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
InipQ3TXT3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
InipQ3TXT3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
InipQ3TXT3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
InipQ3TXT3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
InipQ3TXT3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
InipQ3TXT3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
InipQ3TXT3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
InipQ3TXT3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
InipQ3TXT3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
InipQ3TXT3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
InipQ3TXT3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
InipQ3TXT3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
InipQ3TXT3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
InipQ3TXT3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
InipQ3TXT3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
InipQ3TXT3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
InipQ3TXT3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
InipQ3TXT3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
InipQ3TXT3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
InipQ3TXT3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms