Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srsf6Q3TWW8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srsf6Q3TWW8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srsf6Q3TWW8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srsf6Q3TWW8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Srsf6Q3TWW8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srsf6Q3TWW8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srsf6Q3TWW8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Srsf6Q3TWW8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srsf6Q3TWW8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Srsf6Q3TWW8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srsf6Q3TWW8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Srsf6Q3TWW8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srsf6Q3TWW8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srsf6Q3TWW8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srsf6Q3TWW8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srsf6Q3TWW8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srsf6Q3TWW8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srsf6Q3TWW8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srsf6Q3TWW8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srsf6Q3TWW8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srsf6Q3TWW8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srsf6Q3TWW8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srsf6Q3TWW8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Srsf6Q3TWW8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srsf6Q3TWW8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srsf6Q3TWW8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srsf6Q3TWW8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srsf6Q3TWW8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Srsf6Q3TWW8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srsf6Q3TWW8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srsf6Q3TWW8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srsf6Q3TWW8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Srsf6Q3TWW8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srsf6Q3TWW8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srsf6Q3TWW8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Srsf6Q3TWW8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srsf6Q3TWW8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srsf6Q3TWW8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Srsf6Q3TWW8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srsf6Q3TWW8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srsf6Q3TWW8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srsf6Q3TWW8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srsf6Q3TWW8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srsf6Q3TWW8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srsf6Q3TWW8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srsf6Q3TWW8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srsf6Q3TWW8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srsf6Q3TWW8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srsf6Q3TWW8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Srsf6Q3TWW8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srsf6Q3TWW8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srsf6Q3TWW8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srsf6Q3TWW8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srsf6Q3TWW8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srsf6Q3TWW8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srsf6Q3TWW8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srsf6Q3TWW8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srsf6Q3TWW8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srsf6Q3TWW8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srsf6Q3TWW8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srsf6Q3TWW8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srsf6Q3TWW8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Srsf6Q3TWW8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srsf6Q3TWW8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srsf6Q3TWW8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Srsf6Q3TWW8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Srsf6Q3TWW8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srsf6Q3TWW8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srsf6Q3TWW8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srsf6Q3TWW8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srsf6Q3TWW8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srsf6Q3TWW8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srsf6Q3TWW8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srsf6Q3TWW8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srsf6Q3TWW8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srsf6Q3TWW8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srsf6Q3TWW8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srsf6Q3TWW8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Srsf6Q3TWW8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srsf6Q3TWW8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srsf6Q3TWW8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Srsf6Q3TWW8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srsf6Q3TWW8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srsf6Q3TWW8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Srsf6Q3TWW8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Srsf6Q3TWW8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srsf6Q3TWW8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Srsf6Q3TWW8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srsf6Q3TWW8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srsf6Q3TWW8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srsf6Q3TWW8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms