Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ctdnep1Q3TP92 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ctdnep1Q3TP92 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ctdnep1Q3TP92 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Ctdnep1Q3TP92 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ctdnep1Q3TP92 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ctdnep1Q3TP92 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ctdnep1Q3TP92 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ctdnep1Q3TP92 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ctdnep1Q3TP92 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ctdnep1Q3TP92 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ctdnep1Q3TP92 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ctdnep1Q3TP92 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ctdnep1Q3TP92 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ctdnep1Q3TP92 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ctdnep1Q3TP92 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ctdnep1Q3TP92 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ctdnep1Q3TP92 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ctdnep1Q3TP92 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ctdnep1Q3TP92 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ctdnep1Q3TP92 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ctdnep1Q3TP92 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ctdnep1Q3TP92 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ctdnep1Q3TP92 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ctdnep1Q3TP92 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ctdnep1Q3TP92 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ctdnep1Q3TP92 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ctdnep1Q3TP92 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ctdnep1Q3TP92 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ctdnep1Q3TP92 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ctdnep1Q3TP92 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ctdnep1Q3TP92 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ctdnep1Q3TP92 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ctdnep1Q3TP92 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ctdnep1Q3TP92 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ctdnep1Q3TP92 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ctdnep1Q3TP92 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ctdnep1Q3TP92 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ctdnep1Q3TP92 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ctdnep1Q3TP92 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ctdnep1Q3TP92 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ctdnep1Q3TP92 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ctdnep1Q3TP92 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ctdnep1Q3TP92 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ctdnep1Q3TP92 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ctdnep1Q3TP92 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ctdnep1Q3TP92 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ctdnep1Q3TP92 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ctdnep1Q3TP92 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ctdnep1Q3TP92 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ctdnep1Q3TP92 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ctdnep1Q3TP92 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ctdnep1Q3TP92 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ctdnep1Q3TP92 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ctdnep1Q3TP92 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ctdnep1Q3TP92 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ctdnep1Q3TP92 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ctdnep1Q3TP92 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ctdnep1Q3TP92 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ctdnep1Q3TP92 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ctdnep1Q3TP92 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ctdnep1Q3TP92 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ctdnep1Q3TP92 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ctdnep1Q3TP92 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ctdnep1Q3TP92 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ctdnep1Q3TP92 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ctdnep1Q3TP92 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ctdnep1Q3TP92 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ctdnep1Q3TP92 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ctdnep1Q3TP92 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ctdnep1Q3TP92 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ctdnep1Q3TP92 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ctdnep1Q3TP92 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ctdnep1Q3TP92 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ctdnep1Q3TP92 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ctdnep1Q3TP92 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ctdnep1Q3TP92 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ctdnep1Q3TP92 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ctdnep1Q3TP92 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ctdnep1Q3TP92 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ctdnep1Q3TP92 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ctdnep1Q3TP92 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ctdnep1Q3TP92 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ctdnep1Q3TP92 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ctdnep1Q3TP92 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ctdnep1Q3TP92 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ctdnep1Q3TP92 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms