Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam172aQ3TNH5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam172aQ3TNH5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam172aQ3TNH5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam172aQ3TNH5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam172aQ3TNH5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam172aQ3TNH5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam172aQ3TNH5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam172aQ3TNH5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam172aQ3TNH5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam172aQ3TNH5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fam172aQ3TNH5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fam172aQ3TNH5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam172aQ3TNH5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam172aQ3TNH5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam172aQ3TNH5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam172aQ3TNH5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam172aQ3TNH5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam172aQ3TNH5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam172aQ3TNH5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam172aQ3TNH5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam172aQ3TNH5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam172aQ3TNH5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam172aQ3TNH5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam172aQ3TNH5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam172aQ3TNH5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam172aQ3TNH5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam172aQ3TNH5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam172aQ3TNH5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam172aQ3TNH5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam172aQ3TNH5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam172aQ3TNH5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam172aQ3TNH5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam172aQ3TNH5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam172aQ3TNH5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam172aQ3TNH5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam172aQ3TNH5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam172aQ3TNH5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam172aQ3TNH5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam172aQ3TNH5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam172aQ3TNH5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam172aQ3TNH5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam172aQ3TNH5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam172aQ3TNH5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam172aQ3TNH5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam172aQ3TNH5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam172aQ3TNH5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam172aQ3TNH5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam172aQ3TNH5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam172aQ3TNH5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam172aQ3TNH5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam172aQ3TNH5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam172aQ3TNH5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam172aQ3TNH5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam172aQ3TNH5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam172aQ3TNH5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam172aQ3TNH5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam172aQ3TNH5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam172aQ3TNH5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam172aQ3TNH5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam172aQ3TNH5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam172aQ3TNH5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam172aQ3TNH5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam172aQ3TNH5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam172aQ3TNH5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam172aQ3TNH5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam172aQ3TNH5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam172aQ3TNH5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam172aQ3TNH5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam172aQ3TNH5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam172aQ3TNH5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam172aQ3TNH5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam172aQ3TNH5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam172aQ3TNH5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam172aQ3TNH5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam172aQ3TNH5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam172aQ3TNH5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms