Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdlim7Q3TJD7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdlim7Q3TJD7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdlim7Q3TJD7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdlim7Q3TJD7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdlim7Q3TJD7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdlim7Q3TJD7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdlim7Q3TJD7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdlim7Q3TJD7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdlim7Q3TJD7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdlim7Q3TJD7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pdlim7Q3TJD7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdlim7Q3TJD7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdlim7Q3TJD7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdlim7Q3TJD7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdlim7Q3TJD7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdlim7Q3TJD7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdlim7Q3TJD7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdlim7Q3TJD7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdlim7Q3TJD7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdlim7Q3TJD7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdlim7Q3TJD7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdlim7Q3TJD7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdlim7Q3TJD7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdlim7Q3TJD7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdlim7Q3TJD7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdlim7Q3TJD7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdlim7Q3TJD7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdlim7Q3TJD7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdlim7Q3TJD7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdlim7Q3TJD7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdlim7Q3TJD7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdlim7Q3TJD7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdlim7Q3TJD7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdlim7Q3TJD7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdlim7Q3TJD7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pdlim7Q3TJD7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Pdlim7Q3TJD7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pdlim7Q3TJD7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pdlim7Q3TJD7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pdlim7Q3TJD7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdlim7Q3TJD7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdlim7Q3TJD7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdlim7Q3TJD7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdlim7Q3TJD7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdlim7Q3TJD7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdlim7Q3TJD7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdlim7Q3TJD7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdlim7Q3TJD7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdlim7Q3TJD7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdlim7Q3TJD7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdlim7Q3TJD7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdlim7Q3TJD7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdlim7Q3TJD7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdlim7Q3TJD7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdlim7Q3TJD7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdlim7Q3TJD7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdlim7Q3TJD7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdlim7Q3TJD7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdlim7Q3TJD7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdlim7Q3TJD7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdlim7Q3TJD7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pdlim7Q3TJD7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Pdlim7Q3TJD7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdlim7Q3TJD7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdlim7Q3TJD7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdlim7Q3TJD7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdlim7Q3TJD7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdlim7Q3TJD7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdlim7Q3TJD7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdlim7Q3TJD7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pdlim7Q3TJD7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pdlim7Q3TJD7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pdlim7Q3TJD7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pdlim7Q3TJD7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pdlim7Q3TJD7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdlim7Q3TJD7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdlim7Q3TJD7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdlim7Q3TJD7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdlim7Q3TJD7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdlim7Q3TJD7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdlim7Q3TJD7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdlim7Q3TJD7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdlim7Q3TJD7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdlim7Q3TJD7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdlim7Q3TJD7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pdlim7Q3TJD7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pdlim7Q3TJD7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pdlim7Q3TJD7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pdlim7Q3TJD7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pdlim7Q3TJD7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdlim7Q3TJD7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdlim7Q3TJD7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdlim7Q3TJD7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdlim7Q3TJD7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdlim7Q3TJD7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdlim7Q3TJD7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdlim7Q3TJD7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdlim7Q3TJD7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms