Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul4aQ3TCH7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul4aQ3TCH7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul4aQ3TCH7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul4aQ3TCH7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul4aQ3TCH7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul4aQ3TCH7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul4aQ3TCH7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul4aQ3TCH7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul4aQ3TCH7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul4aQ3TCH7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul4aQ3TCH7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul4aQ3TCH7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul4aQ3TCH7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul4aQ3TCH7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul4aQ3TCH7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul4aQ3TCH7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul4aQ3TCH7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul4aQ3TCH7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul4aQ3TCH7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul4aQ3TCH7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul4aQ3TCH7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul4aQ3TCH7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul4aQ3TCH7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul4aQ3TCH7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul4aQ3TCH7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul4aQ3TCH7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul4aQ3TCH7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul4aQ3TCH7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul4aQ3TCH7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Cul4aQ3TCH7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Cul4aQ3TCH7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cul4aQ3TCH7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cul4aQ3TCH7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul4aQ3TCH7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul4aQ3TCH7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul4aQ3TCH7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul4aQ3TCH7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul4aQ3TCH7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul4aQ3TCH7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul4aQ3TCH7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul4aQ3TCH7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul4aQ3TCH7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul4aQ3TCH7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cul4aQ3TCH7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cul4aQ3TCH7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cul4aQ3TCH7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cul4aQ3TCH7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cul4aQ3TCH7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cul4aQ3TCH7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cul4aQ3TCH7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cul4aQ3TCH7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cul4aQ3TCH7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cul4aQ3TCH7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cul4aQ3TCH7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cul4aQ3TCH7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cul4aQ3TCH7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cul4aQ3TCH7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cul4aQ3TCH7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul4aQ3TCH7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul4aQ3TCH7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul4aQ3TCH7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul4aQ3TCH7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul4aQ3TCH7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cul4aQ3TCH7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cul4aQ3TCH7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cul4aQ3TCH7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cul4aQ3TCH7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cul4aQ3TCH7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cul4aQ3TCH7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cul4aQ3TCH7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cul4aQ3TCH7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cul4aQ3TCH7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cul4aQ3TCH7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cul4aQ3TCH7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cul4aQ3TCH7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul4aQ3TCH7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cul4aQ3TCH7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms