Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3KNL4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3KNL4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3KNL4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3KNL4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3KNL4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3KNL4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3KNL4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3KNL4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3KNL4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q3KNL4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3KNL4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3KNL4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3KNL4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3KNL4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3KNL4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3KNL4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3KNL4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3KNL4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3KNL4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3KNL4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3KNL4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3KNL4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3KNL4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3KNL4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3KNL4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3KNL4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3KNL4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3KNL4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3KNL4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3KNL4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3KNL4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3KNL4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3KNL4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3KNL4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3KNL4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3KNL4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3KNL4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3KNL4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3KNL4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3KNL4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q3KNL4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q3KNL4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q3KNL4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3KNL4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3KNL4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3KNL4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3KNL4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3KNL4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3KNL4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3KNL4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3KNL4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3KNL4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3KNL4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3KNL4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3KNL4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3KNL4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3KNL4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3KNL4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3KNL4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3KNL4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3KNL4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3KNL4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3KNL4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3KNL4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3KNL4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3KNL4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3KNL4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3KNL4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3KNL4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3KNL4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3KNL4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3KNL4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3KNL4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3KNL4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3KNL4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q3KNL4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms