Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptcd3Q14C51 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptcd3Q14C51 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptcd3Q14C51 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptcd3Q14C51 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptcd3Q14C51 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptcd3Q14C51 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms