Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Tdrd9Q14BI7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Tdrd9Q14BI7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Tdrd9Q14BI7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Tdrd9Q14BI7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Tdrd9Q14BI7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Tdrd9Q14BI7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Tdrd9Q14BI7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Tdrd9Q14BI7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Tdrd9Q14BI7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Tdrd9Q14BI7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Tdrd9Q14BI7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Tdrd9Q14BI7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Tdrd9Q14BI7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Tdrd9Q14BI7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Tdrd9Q14BI7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Tdrd9Q14BI7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Tdrd9Q14BI7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Tdrd9Q14BI7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Tdrd9Q14BI7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Tdrd9Q14BI7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Tdrd9Q14BI7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Tdrd9Q14BI7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Tdrd9Q14BI7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Tdrd9Q14BI7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Tdrd9Q14BI7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Tdrd9Q14BI7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Tdrd9Q14BI7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Tdrd9Q14BI7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Tdrd9Q14BI7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Tdrd9Q14BI7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Tdrd9Q14BI7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Tdrd9Q14BI7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Tdrd9Q14BI7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Tdrd9Q14BI7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Tdrd9Q14BI7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Tdrd9Q14BI7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Tdrd9Q14BI7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Tdrd9Q14BI7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Tdrd9Q14BI7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Tdrd9Q14BI7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Tdrd9Q14BI7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Tdrd9Q14BI7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Tdrd9Q14BI7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Tdrd9Q14BI7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Tdrd9Q14BI7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Tdrd9Q14BI7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Tdrd9Q14BI7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Tdrd9Q14BI7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Tdrd9Q14BI7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Tdrd9Q14BI7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Tdrd9Q14BI7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Tdrd9Q14BI7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Tdrd9Q14BI7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Tdrd9Q14BI7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Tdrd9Q14BI7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Tdrd9Q14BI7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Tdrd9Q14BI7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Tdrd9Q14BI7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Tdrd9Q14BI7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Tdrd9Q14BI7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Tdrd9Q14BI7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Tdrd9Q14BI7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Tdrd9Q14BI7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Tdrd9Q14BI7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Tdrd9Q14BI7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Tdrd9Q14BI7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Tdrd9Q14BI7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Tdrd9Q14BI7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Tdrd9Q14BI7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Tdrd9Q14BI7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Tdrd9Q14BI7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Tdrd9Q14BI7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Tdrd9Q14BI7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Tdrd9Q14BI7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Tdrd9Q14BI7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Tdrd9Q14BI7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Tdrd9Q14BI7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Tdrd9Q14BI7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Tdrd9Q14BI7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Tdrd9Q14BI7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Tdrd9Q14BI7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Tdrd9Q14BI7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Tdrd9Q14BI7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Tdrd9Q14BI7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Tdrd9Q14BI7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Tdrd9Q14BI7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Tdrd9Q14BI7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Tdrd9Q14BI7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Tdrd9Q14BI7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Tdrd9Q14BI7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Tdrd9Q14BI7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Tdrd9Q14BI7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Tdrd9Q14BI7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Tdrd9Q14BI7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Tdrd9Q14BI7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Tdrd9Q14BI7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Tdrd9Q14BI7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Tdrd9Q14BI7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Tdrd9Q14BI7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms